Transporter Proteins in

Escherichia coli K12-MG1655

     

Confidence Level of Functional Assignments:

weak

Weak Bioinformatic Evidence

strong

Strong Bioinformatic Evidence

experimental

Experimental Evidence


     
The ATP-binding Cassette (ABC) Superfamily
PROTEINSUBSTRATE
ABCmembranebinding protein
YadG(b0127)
 0
YadH(b0128)
 6

? 3.A.1.X.X weak
YhbG(b3201)
 0

YhbN(b3200)
 0
? 3.A.1.X.X weak
YbbL(b0490)
 0
YbbM(b0491)
 7

? 3.A.1.X.X weak
YbbA(b0495)
 0
YbbP(b0496)
 10

? 3.A.1.X.X weak
YcjV(b1318)
 0


? 3.A.1.X.X weak
sufC(b1682)
 0
sufB(b1683)
 0
sufD(b1681)
 0

? (Fe-S assembly/SufBCD system)
YjjK(b4391)
 0


? (Uup homolog/duplicated ATPase) 3.A.1.2.X weak
YheS(b3352)
 0


? (Uup homolog/duplicated ATPase) 3.A.1.X.X weak
Uup(b0949)
 0


? (Uup homolog/duplicated ATPase) 3.A.1.X.X weak
ybiT(b0820)
 0


? (Uup homolog/duplicated ATPase)

CydD(b0887)*
 5
CydC(b0886)*
 6

aerobic respiration? 3.A.1.129.1 experimental
SsuB(b0933)
 0
SsuC(b0934)
 7
SsuA(b0936)
 0
alkane sulfonate 3.A.1.17.2 strong
PhnC(b4106)
 0
PhnE(b4104)
 3
PhnD(b4105)
 0
alkylphosphonate 3.A.1.9.1 experimental
alsA(b4087)
 0
alsC(b4086)
 9
alsB(b4088)
 1
allose/ribose 3.A.1.2.6 experimental
YhdZ(b3271)
 0
YhdY(b3270)
 8
YhdX(b3269)
 5
YhdW(b3268)
 0
amino acid? 3.A.1.3.X strong
AraG(b1900)
 0
AraH(b4460)
 10
AraF(b1901)
 0
arabinose 3.A.1.2.2 experimental
ArtP(b0864)
 0
ArtQ(b0862)
 4
ArtM(b0861)
 5
ArtJ(b0860)
 0
arginine 3.A.1.3.3 experimental
LivG(b3455)
 0
LivF(b3454)
 0
LivM(b3456)
 10
LivH(b3457)
 8
LivJ(b3460)
 1
branched-chain amino acid 3.A.1.4.1 experimental
FtsE(b3463)
 0
FtsX(b3462)
 4

cell division 3.A.1.X.X weak
YecC(b1917)
 0
YecS(b1918)
 3
FliY(b1920)
 0
cystine 3.A.1.3.10 experimental
metN(b0199)
 0
metI(b0198)
 5
metQ(b0197)
 0
D-methionine 3.A.1.24.1 experimental
DppF(b3540)
 0
DppD(b3541)
 0
DppC(b3542)
 5
DppB(b3543)
 6
DppA(b3544)
 0
dipeptides 3.A.1.5.2 experimental

macB(b0879)*
 4

drug efflux? 3.A.1.122.1 strong

MsbA(b0914)*
 5

drug efflux? 3.A.1.106.1 strong

YddA(b1496)*
 5

efflux? 3.A.1.X.X weak
FepC(b0588)
 0
FepG(b0589)
 8
FepD(b0590)
 9
FepB(b0592)
 0
ferric enterobactin 3.A.1.14.2 experimental
AfuC(b0262)
 0
AfuB(b0263)
 2

ferric ion 3.A.1.6.X weak
FhuC(b0151)
 0
FhuB(b0153)
 17
FhuD(b0152)
 0
ferrichrome 3.A.1.14.3 experimental
MglA(b2149)
 0
MglC(b2148)
 9
MglB(b2150)
 1
galactosides 3.A.1.2.3 experimental
GltL(b0652)
 0
GltK(b0653)
 5
GltJ(b0654)
 5
gltI(b0655)
 0
glutamate/aspartate 3.A.1.3.4 experimental
GlnQ(b0809)
 0
GlnP(b0810)
 3
GlnH(b0811)
 0
glutamine 3.A.1.3.2 experimental
UgpC(b3450)
 0
UgpE(b3451)
 6
UgpA(b3452)
 6
UgpB(b3453)
 0
glycerol-3-phosphate 3.A.1.1.3 experimental
ProV(b2677)
 0
ProW(b2678)
 6
ProX(b2679)
 0
glycine betaine/L-proline 3.A.1.12.1 strong
YehX(b2129)
 0
YehY(b2130)
 10
YehW(b2128)
 6
YehZ(b2131)
 0
glycine betaine/L-proline 3.A.1.6.X weak
CcmA(b2201)
 0
CcmC(b2199)
 6
CcmB(b2200)
 6

heme export 3.A.1.37.1 experimental
FecE(b4287)
 0
FecD(b4288)
 7
FecC(b4289)
 8
FecB(b4290)
 1
iron dicitrate 3.A.1.14.1 experimental
ynjD(b1756)
 0
ynjC(b1755)
 12
ynjB(b1754)
 0
iron(III)/spermidine/putrescine? 3.A.1.X.X weak
YcfV(b1117)
 0
YcfW(b1118)
 4
YcfU(b1116)
 4

lipoprotein releasing? 3.A.1.125.1 weak
HisP(b2306)
 0
HisQ(b2308)
 5
HisM(b2307)
 4
ArgT(b2310)
 0
lysine/arginine/ornithine 3.A.1.3.1 experimental
MalK(b4035)
 0
MalG(b4032)
 6
MalF(b4033)
 8
MalE(b4034)
 0
maltose 3.A.1.1.1 experimental

YcjO(b1311)
 6
YcjP(b1312)
 7
ycjN(b1310)
 0
maltose? 3.A.1.1.X strong
ModF(b0760)
 0
ModC(b0765)
 0
ModB(b0764)
 5
ModA(b0763)
 0
molybdate 3.A.1.8.X weak

YojI(b2211)*
 6

multidrug 3.A.1.113.3 weak

YhiH(b3486)*
 5
YhhJ(b3485)
 5

multidrug? 3.A.1.X.X weak

MdlB(b0449)*
 4
MdlA(b0448)*
 6

multidrug? 3.A.1.36.X strong
YbhF(b0794)
 0
YbhR(b0792)*
 6
YbhS(b0793)
 6

multidrug? 3.A.1.X.X weak
NikE(b3480)
 0
NikD(b3479)
 0
NikC(b3478)
 6
NikB(b3477)
 6
NikA(b3476)
 0
nickel 3.A.1.5.3 experimental
YejF(b2180)
 0
YejE(b2179)
 6
YejB(b2178)
 6
YejA(b2177)
 1
oligopeptide 3.A.1.5.X strong
OppF(b1247)
 0
OppD(b1246)
 0
OppC(b1245)
 6
OppB(b1244)
 6
OppA(b1243)
 1
oligopeptides 3.A.1.5.1 experimental


ygiS(b3020)
 0
oligopeptides 3.A.1.5.X strong
SapF(b1290)
 0
SapD(b1291)
 0
SapC(b1292)
 5
SapB(b1293)
 5
SapA(b1294)
 0
peptide uptake 3.A.1.5.5 experimental
yliA(b0829)
 0
yliD(b0832)
 6
yliC(b0831)
 6
yliB(b0830)
 0
peptides 3.A.1.5.11 strong
yddP(b1484)
 0
yddO(b1483)
 0
yddR(b1486)
 7
yddQ(b1485)
 5
yddS(b1487)
 0
peptides? 3.A.1.5.X strong
PstB(b3725)
 0
PstC(b3727)
 6
PstA(b3726)
 6
PstS(b3728)
 1
phosphate 3.A.1.7.1 experimental
PhnL(b4096)
 0
PhnK(b4097)
 0


phosphonate? 3.A.1.9.X weak
PotG(b0855)
 0
PotI(b0857)
 6
PotH(b0856)
 6
PotF(b0854)
 0
putrescine 3.A.1.11.2 experimental
PotA(b1126)
 0
PotC(b1124)
 6
PotB(b1125)
 6
PotD(b1123)
 0
putrescine/spermidine 3.A.1.11.1 experimental
RbsA(b3749)
 0
RbsC(b3750)
 8
RbsB(b3751)
 0
ribose 3.A.1.2.1 experimental
YtfR(b4485)
 0
YtfT(b4230)
 10
yjfF(b4231)
 8
YtfQ(b4227)
 1
ribose 3.A.1.2.X strong
ego(b1513)
 0
YdeZ(b1515)
 9
YdeY(b1514)
 9
yneA(b1516)
 0
ribose? 3.A.1.2.8 strong
ydcT(b1441)
 0
ydcV(b1443)
 6
ydcU(b1442)
 8
ydcS(b1440)
 0
spermidine 3.A.1.11.X strong
YphE(b2547)
 0
YphD(b2546)
 8
YphF(b2548)
 0
sugar? 3.A.1.2.X strong
TauB(b0366)
 0
TauC(b0367)
 6
TauA(b0365)
 0
taurine 3.A.1.17.1 experimental
YabJ(b0066)
 0
YabK(b0067)
 12
TbpA(b0068)
 0
thiamine 3.A.1.19.1 experimental
CysA(b2422)
 0
CysW(b2423)
 6
CysU(b2424)
 7
CysP(b2425)
 0
sbp(b3917)
 0
thiosulfate 3.A.1.6.1 experimental
YrbF(b3195)
 0
YrbE(b3194)
 5
YrbD(b3193)?
 1
YrbC(b3192)?
 0
toluene/organic solvents? 3.A.1.X.X weak
BtuD(b1709)
 0
BtuC(b1711)
 9
YadT(b0158)
 0
vitamin B12 3.A.1.13.1 experimental
XylG(b3567)
 0
XylH(b3568)
 10
XylF(b3566)
 0
xylose 3.A.1.2.4 experimental
znuC(b1858)
 0
znuB(b1859)
 7
znuA(b1857)
 0
zinc ion 3.A.1.15.5 experimental
*   contains both an ABC and a membrane domain as one polypeptide
**   contains both a membrane domain and a binding protein domain as one polypeptide